Смотрите, выплата премии и стимуриющих выплат носит необязательный характер.
Это право, а не обязанность работодателя согласно ст. 191 ТК РФ.
Так как Вас переводят на пол ставки, соответственно и выплаты будут только согласно ставке и условиям договора.
Если до момента перевода работали на полной ставке - до момента перевода должна выплатить в полном объеме без ограничений.
Более того, если премия (выплата) указана в трудовом договоре, работодатель обязан производить выплаты. Официально нет никаких баллов, это внутренние баллы за показатели на работе. Баллы согласно ТК РФ не предусмотрены.
Советую обращаться с жалобой в ГИТ Роструда.
Возможно, работодателя привлекут к ответственности согласно ст. 5.27 КоАП РФ.