Смотрите, как правило, отпускные рассчитываются исходя из среднего заработка за 12 мес., предшествующих отпуску.
Если работали по ставке 37 часов, в этом случае отпуск должны рассчитать по ставке 12 часов.
Если бухгалтерия стоит на своем, подайте претензию на имя руководителя учреждения с просьбой провести проверку и произвести перерасчет по отпускным.
Если отказ или игнор, тогда обращайтесь с жалобой в ГИТ Роструда для проведения проверки и возможно, привлечение к ответственности работодателя по ст. 5.27 КоАП РФ.
Правильно расчета отпускных официально могут прокуратура и трудовая инспекция.
Далее с исковым заявлением в суд, если вопрос не разрешится (ст. 392 ТК РФ, ст. 131-132 ГПК РФ).