Игорь, требовать, чтобы Вы выкупили ее долю именно за 2 млн р., она не может: выкуп только по договоренности, цену стороны согласуют сами. Если не договоритесь, вопрос решает суд при разделе имущества.
Что важно для раздела. То, что ипотеку платили Вы один, само по себе долю не увеличивает: заработанное в браке считается общим доходом супругов, независимо от того, на чье имя он получен (п. 2 ст. 34 СК РФ), а доли при разделе по общему правилу равные (п. 1 ст. 39 СК РФ). Ваш главный довод другой: 500 тыс. р., подаренные отцом. Имущество, полученное одним из супругов в браке в дар, его личное (п. 1 ст. 36 СК РФ). Если докажете, что деньги подарены именно Вам и ушли в ипотеку, можно требовать, чтобы эта часть стоимости квартиры не делилась пополам. Доказательства: перевод от отца на Ваш счет, письменный договор дарения или расписка, платеж в банк вскоре после перевода.
Перед любыми переговорами о цене стоит заказать оценку квартиры и справку банка об остатке долга: 2 млн р. нужно сравнить с половиной реальной стоимости за вычетом половины долга и подаренной суммы.
Напишите, использовали ли материнский капитал, сколько осталось по ипотеке и как отец передал деньги (переводом или наличными), скажу, на какую долю реально рассчитывать.