Здравствуйте!
Самозанятость никак не влияет, ибо не является трудовой деятельностью -есть разъяснения СФР на эту тему.
Кроме того, в отпуске считается работающим, поэтому, также только чтобы была неполная занятость.
Именно неполная занятость должна быть официально оформлена, ибо недавно по ст. 159.2 УК РФ суды идут из-за того, что организация не те сведения оформила и женщина пострадала. https://www.9111.ru/questions/24881070/
Пусть справку закажет с работы о частичной занятости с датами и печатями.