Здраствуйте!
Да, Вы можете подать заявление о признании себя банкротом, даже если у Вас есть ипотека, оформленная на супруга, а Вы выступаете поручителем и имеете долю в недвижимости.
Согласно Федеральному закону №127-ФЗ «О несостоятельности (банкротстве)», наличие ипотеки не лишает права обратиться в суд с заявлением о банкротстве.
При процедуре банкротства кредитор имеет право обратить взыскание на имущество должника, включая недвижимость, находящуюся в залоге, однако в Вашем случае квартира оформлена на Вашего супруга, следовательно, предметом взыскания она являться не будет автоматически.