Оформление Визы студенту

Такая ситуация: гражданин Афганистана на протяжении 6 лет находился на территории России, поскольку здесь учился в университете. Когда после получения диплома он поступил в магистратуру, то так получилось, что ему сократили визу, т.к. он вовремя не смог оплатить за учёбу и начали придираться и нашли нелепую причину- что что-то в его родном паспорте не так и т.д.. Хотя 6 лет было все нормально и никто нечего не говорил. Дело в том, что данный человек не поехал к себе на родину, а остался в России. В Афганистане неспокойное положение и ехать туда было бы опасно. Сейчас в посольстве ему сделали новый паспорт, но чтобы продолжать находиться в России нужна виза. Вопрос: есть какой-либо способ её получить без выезда на родину. Его могут не пустить обратно и он очень переживает из-за этого. А в России у него останется будущая жена. Посоветуйте что делать, пожалуйста.