Здравствуйте.
Обращаться изначально к тому, с кем заключали договор. Возможно, Вы работали в рамках аутсорсинга или аутстаффинга (скорее всего, второй вариант, если зарплату получали от другой компании).
Вообще, по трудовым спорам не предусмотрен обязательный досудебный порядок. А трудовая инспекция контролирует только нарушения в рамках своих полномочий. Взыскать заработную плату возможно в судебном порядке. Можно привлечь в качестве ответчиков все организации. Но вообще, ответчик - та компания, с которой заключали трудовой договор. И также та, которая выплачивала командировочные.
С уважением.