Как оформить наследство, если нет регистрации в юстиции

В 1999 году была приватизирована комната в коммунальной квартире. В приватизации (по прописке) участвовали я и мой отец. Договор приватизации был зарегистрирован в мэрии города, но не было регистрации в учреждении юстиции. После смерти отца (04.2010) в установленные сроки обратилась к нотариусу для оформления наследства. Нотариус отправляет в суд: у отца не было права собственности на свою долю, из-за отсутствия регистрации в юстиции.