По ч. 2 ст. 12.26 КоАП РФ ответственность возможна только если будет доказано, что именно Вы управляли автомобилем и после этого не выполнили законное требование о прохождении медицинского освидетельствования.
Если сотрудники ДПС не видели Вас за рулем, а видеозапись подтверждает, что к моменту их приезда Вы уже находились возле заглушенного автомобиля, эту запись обязательно нужно представить при рассмотрении дела и заявить, что факт управления Вами транспортным средством не доказан.
Сам протокол сейчас отдельно обжаловать не нужно. Подайте письменные возражения, приложите видеозапись и ходатайствуйте о ее приобщении к делу. Если суд все же вынесет постановление о привлечении к ответственности, его можно обжаловать в течение 10 суток со дня получения копии — ст. 30.1–30.3 КоАП РФ.
Важно сохранить оригинал видеозаписи с датой и временем, а не только отдельный фрагмент.