Старое завещание может сохранить силу в части первой квартиры, если новое завещание не содержит прямого указания об отмене прежнего завещания целиком и не противоречит ему в этой части.
Пункт 2 ст. 1130 ГК РФ устанавливает: последующее завещание без прямого указания об отмене прежнего отменяет его только полностью или в той части, в которой оно противоречит новому.
То есть если в старом завещании 1/2 первой квартиры оставлена старшему сыну, а в новом завещании Вы распорядитесь только 1/2 второй квартиры и новой квартирой, распоряжение о первой квартире может продолжать действовать.
Чтобы после открытия наследства не возник спор о соотношении двух завещаний, практичнее сразу сообщить нотариусу о прежнем завещании и сформулировать новое так, чтобы прямо указать, какие прежние распоряжения сохраняются, а какие изменяются.