Выделяют доли только тем детям, маткапитал которых был на момент получения согласия СФР. Доплата за новорождённого будет отражаться на счёте в СФР и индексироваться, использовать можно на разрешённые цели, в том числе кроме недвижимости(пенсия родителей, обучение детей, средства для детей-инвалидов и т.д.)
Ребёнку рождённому после распределения долей в приобретённой квартире выделять не нужно во вновь приобретаемой.
Если Росреестр приостановит сделку, то обращение в суд по КАС РФ в течение 3 месяцев по обжалованию отказа, а также в прокуратуру можете обратиться и в сам Росреестр к руководству на этапе досудебного обжалования.