Как оценить стоимость унаследованной 38 доли в квартире 64 кв.м, если есть решение суда о пользовании дедом конкретной комнатой 12.4 кв.м с лоджией

Юридически — нет, если только это не было зафиксировано как обременение в ЕГРН (что для права пользования почти никогда не делается).

Решение мирового судьи об определении порядка пользования носит персональный характер. Оно принималось исходя из интересов конкретных людей (вашего деда и тех собственников) на тот момент времени.

Поскольку собственник сменился (пришли вы), старый порядок пользования аннулируется. Вам нужно либо договариваться с соседями о новом порядке, либо снова идти в суд.

Хотя решение на вас не переходит автоматически, оно является мощным прецедентом. Если вы пойдете в суд, судья с большой вероятностью примет такое же решение, какое было у деда, так как планировка квартиры не изменилась.