Здравствуйте, Виктория!
Ситуация, в которой здание находится в собственности вашей организации, а земля под ним — в государственной собственности и частично уже отчуждена третьему лицу, действительно непростая, но не безвыходная.
Согласно статье 36 Земельного кодекса РФ, юридические лица, в собственности которых находятся здания или сооружения, расположенные на государственном или муниципальном земельном участке, имеют право на оформление этого участка в собственность или в аренду, в зависимости от категории земли и разрешённого использования. Это право может быть реализовано при условии, что участок не изъят из оборота и не ограничен в обороте.
Однако, поскольку часть земли уже отчуждена, необходимо уточнить, затрагивает ли эта часть непосредственно территорию под зданием и его эксплуатационную зону. Если здание фактически находится на участке, уже переданном третьему лицу, это создаёт серьёзные препятствия. Если же здание стоит на свободной части участка, можно инициировать процедуру межевания и выделения отдельного земельного участка под объектом недвижимости. В таком случае организация может подать заявление о предоставлении участка в собственность в порядке, предусмотренном статьёй 39.20 ЗК РФ (предоставление участка без торгов собственнику объекта недвижимости).
Рекомендую начать с получения кадастровой выписки по земле и выяснения, на каком основании и как именно был продан участок частному лицу. Далее — провести межевание, чтобы зафиксировать границы фактического пользования землёй под зданием. Эти действия позволят определить, возможно ли сформировать отдельный участок и инициировать процедуру выкупа или оформления права пользования.
Если администрация не выразит согласие на передачу, может встать вопрос об оспаривании сделок с землёй, если будет доказано, что участок продан с нарушением прав вашей организации, как собственника объекта недвижимости.
С пониманием отношусь к сложности ситуации, особенно с учётом упущенного времени, но правовая защита интересов организации возможна при грамотных действиях.
С наилучшими пожеланиями, Хабас Феликсович.