Изменение стимулирующих надбавок без предупреждения: законно ли снижение процентов при росте оклада?

Здравствуйте. В моей организации зарплата начисляется следующим образом: оклад + стимулирующая надбавка (проценты). Согласно трудовому договору, в случае внесения изменений в стимулирующие надбавки работодатель ОБЯЗАН оповестить об этом сотрудников не менее чем за 3 месяца, с последующим выпуском нового положения и подписания им сотрудником. Стимулирующие таблицы заполняются раз в квартал и сотрудники получают определенную сумму на протяжении одного квартала. Произошла ситуация: мы подали стимулы на ближайшие три месяца, из министерства образования спускают бумагу о том, что нам проиндексировали окладную часть, на что наша организация вносит изменения в стимулирующие таблицы, чтобы сотрудники, с учетом изменения окладной части не получили больше определенной суммы. То есть, оклад повысился, проценты в стимулах уменьшились, зарплата сотрудника не изменилась. Организация аргументирует свои действия тем, что в зарплатном фонде нет средств на повышение окладной части и чтобы всем выплатить заработную плату, они просто уменьшили проценты без предварительного ознакомления. Может ли организация действовать таким образом, если в трудовом договоре прописаны условия изменения стимулирующей надбавки?