Двойная регистрация при покупке квартиры с маткапиталом: как учитываются доли детей?

Здравствуйте, купили квартиру в ипотеку, с использованием материнского капитала и государственного жилищного сертификат.Детей двое. Детям выделились доли из вложенных денежных средств. По прописке с детьми и регистрации указан прежний адрес. До приобретения квартиры в ипотеку в другом городе.Сейчас получается у меня две регистрации. Как в данной ситуации они будут считаться с юридической стороны?