Здравствуйте!
Изучил вашу проблему и советую рассмотреть два варианта.
Вариант №1 — заключение агентского договора
Вашей организации целесообразно выступить агентом, принимающим платежи от клиентов за оказание транспортных услуг, оказываемых третьими лицами (нерезидентами).
Согласно условиям агентского договора, агент получает вознаграждение за выполнение посреднических функций, а основную сумму платежа направляет принципалу (услугодателю).
При таком подходе ваша организация сможет учитывать поступления только как доход агента (вознаграждение), что значительно снизит налогооблагаемую базу.
Вариант №2 — смена налогового режима (если возможен)
Для ПСН доступна упрощённая схема налогообложения доходов без налога на прибыль и НДС. Однако для вашего бизнеса этот режим вряд ли подойдёт, поскольку транспортные перевозки международного характера не попадают под перечень видов деятельности, допускаемых на патент.
Вы можете выбрать объект налогообложения "Доходы минус расходы" (ставка 15%), где вы сможете учесть затраты на оплату услуг нерезидентов. Это уменьшит налоговую нагрузку существенно, так как базой станет разница между доходами и расходами.
Чтобы сменить режим на "Доходы минус расходы", нужно подать уведомление о переходе в налоговую инспекцию заранее (не позднее определённого срока, установленного законом).