Здравствуйте, Анастасия!
Понимаю вашу ситуацию, и она нередко вызывает у людей растерянность, особенно после увольнения. Согласно статье 137 Трудового кодекса РФ, удержание из заработной платы допускается, в том числе, для возврата излишне выплаченных сумм, но только если это произошло из-за счетной ошибки. Переплата из-за неправильного табелирования, как правило, считается именно такой счетной ошибкой, потому что речь идёт о техническом сбое или неточности в учете рабочего времени.
Это означает, что работодатель вправе потребовать возврата излишне выплаченных средств, а при вашем отказе — может обратиться в суд. Однако он не может самовольно удержать эту сумму из расчёта, если вы уже уволились и расчёт произведён полностью — ему придётся взыскивать сумму через суд, доказав факт ошибки.
Если сумма переплаты незначительная, работодатель может и не настаивать на возврате. Но если сумма крупная, есть вероятность, что они будут добиваться возврата официальным путём. Рекомендую сохранить все документы, подтверждающие, что вы действовали добросовестно, и сами не имели отношения к ошибке.
С наилучшими пожеланиями, Хабас Феликсович.