Здравствуйте, Николай!
Вы не обязаны проходить ежегодную медицинскую комиссию в свой выходной день — это нарушение трудового законодательства. Согласно части 1 статьи 185.1 Трудового кодекса РФ, работодатель обязан освобождать работника от работы на время прохождения обязательных медицинских осмотров с сохранением места работы и среднего заработка.
Если медкомиссия назначена на ваш выходной, вы вправе попросить переноса на рабочий день либо потребовать компенсации за работу в выходной, если всё-таки пойдёте — в соответствии со статьей 153 ТК РФ. Это считается работой в выходной день и оплачивается как минимум в двойном размере.
Вы имеете полное право на отдых и защиту своих трудовых прав. Если будут настаивать — можно вежливо сослаться на указанные статьи и попросить оформить всё официально.
С наилучшими пожеланиями, Хабас Феликсович.