Я прохожу альтернативную гражданскую службу Моя служба подходит к концу через

Здравствуйте. Я прохожу альтернативную гражданскую службу. Моя служба подходит к концу через 2 недели. Но работодатель говорит что через месяц так как после приезда к месту несения службы я ещё 2 недели проходил медкомиссию по их требованию (медкомиссия в военкомате была пройдена). Я сослался на 113 федеральный закон статья 5 пункт 3, что начало АГС гражданина считается день его убытия к месту прохождения АГС указаны в предписании военного комиссариата. На что получил ответ: мы связывались с министерством обороны и оно сказало что служба начинается с момента заключения трудового договора с компанией в которой я служу. Насколько их действия правомерные? Что делать в такой ситуации?