Если платить частями долг по кредиту а не всю сумму

Здравствуйте!

Нет, таких оснований для 159-ой не будет.

Подать может, но будет отказано в возбуждении дела

Добрый день 

Подать можно, но скорее всего будет отказ в возбуждении дела

Дарья, здравствуйте, если должник предпринимает любые действия для погашения кредита,в том числе и вносит часть средств, то заявление о мошенничестве не будет соответствовать действительности и до суда дело не дойдет.

Добрый день!

Нет, в вашем случае состава преступления по ст. 159 УК РФ, не будет, поэтому дело до суда не дойдёт.